Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms