Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms