Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms