Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms