Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms