Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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