Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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