Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP3P54852 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP3P54852 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms