Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms