Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms