Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms