Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms