Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms