Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPB2P35606 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPB2P35606 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPB2P35606 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms