Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR7P32248 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR7P32248 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCR7P32248 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCR7P32248 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms