Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA13P31271 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms