Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms