Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms