Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms