Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms