Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms