Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLDCP23378 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLDCP23378 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLDCP23378 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GLDCP23378 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms