Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms