Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms