Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBTFP17480 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBTFP17480 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms