Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms