Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMC1P11047 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMC1P11047 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LAMC1P11047 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms