Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms