Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI1P08151 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms