Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms