Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3P05106 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms