Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms