Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms