Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms