Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRTM2O43300 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRTM2O43300 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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