Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3B1O00203 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms