Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E9PBE3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms