Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L13C9JLJ4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms