Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms