Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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