Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms