Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms