Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPQQ9Y646 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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