Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ATG4BQ9Y4P1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ATG4BQ9Y4P1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ATG4BQ9Y4P1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ATG4BQ9Y4P1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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