Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms