Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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