Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms