Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms