Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms