Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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